MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.06

Total Repeats: 371

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019775	TAA	2	6	477	482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440685391
2	NC_019775	T	6	6	483	488	0 %	100 %	0 %	0 %	440685391
3	NC_019775	TTC	2	6	504	509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685391
4	NC_019775	AGAT	2	8	522	529	50 %	25 %	25 %	0 %	440685391
5	NC_019775	CT	3	6	636	641	0 %	50 %	0 %	50 %	440685391
6	NC_019775	GCT	2	6	679	684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440685391
7	NC_019775	ACC	2	6	917	922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440685391
8	NC_019775	CGTC	2	8	930	937	0 %	25 %	25 %	50 %	440685391
9	NC_019775	TCT	2	6	953	958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685391
10	NC_019775	T	6	6	981	986	0 %	100 %	0 %	0 %	440685391
11	NC_019775	TTA	2	6	1018	1023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440685391
12	NC_019775	AAC	2	6	1156	1161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440685392
13	NC_019775	AGC	2	6	1178	1183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685392
14	NC_019775	TCC	2	6	1200	1205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440685392
15	NC_019775	CT	3	6	1232	1237	0 %	50 %	0 %	50 %	440685392
16	NC_019775	CAT	2	6	1273	1278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685392
17	NC_019775	TATT	2	8	1291	1298	25 %	75 %	0 %	0 %	440685392
18	NC_019775	TGC	2	6	1302	1307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440685392
19	NC_019775	TGA	2	6	1344	1349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440685392
20	NC_019775	TAT	2	6	1558	1563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440685392
21	NC_019775	CAA	2	6	1672	1677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440685392
22	NC_019775	TCT	2	6	1697	1702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685392
23	NC_019775	CTT	2	6	1810	1815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685392
24	NC_019775	AGC	2	6	1865	1870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685392
25	NC_019775	TTG	2	6	1898	1903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440685392
26	NC_019775	AGC	2	6	1946	1951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685392
27	NC_019775	CCTT	2	8	1989	1996	0 %	50 %	0 %	50 %	440685392
28	NC_019775	ACCA	2	8	2048	2055	50 %	0 %	0 %	50 %	440685392
29	NC_019775	CTT	2	6	2089	2094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685392
30	NC_019775	T	6	6	2139	2144	0 %	100 %	0 %	0 %	440685392
31	NC_019775	GAT	2	6	2176	2181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440685392
32	NC_019775	GGC	2	6	2198	2203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440685392
33	NC_019775	CTT	2	6	2209	2214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685392
34	NC_019775	ATC	2	6	2270	2275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685392
35	NC_019775	T	7	7	2301	2307	0 %	100 %	0 %	0 %	440685392
36	NC_019775	TTA	2	6	2358	2363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440685392
37	NC_019775	TCA	2	6	2400	2405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685392
38	NC_019775	T	6	6	2406	2411	0 %	100 %	0 %	0 %	440685392
39	NC_019775	T	6	6	2501	2506	0 %	100 %	0 %	0 %	440685392
40	NC_019775	TTC	2	6	2513	2518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685392
41	NC_019775	CAG	2	6	2539	2544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685392
42	NC_019775	TCT	2	6	2554	2559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685392
43	NC_019775	TTC	2	6	2615	2620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685392
44	NC_019775	CTC	2	6	2621	2626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440685392
45	NC_019775	TCTT	2	8	2628	2635	0 %	75 %	0 %	25 %	440685392
46	NC_019775	TAA	2	6	2641	2646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440685392
47	NC_019775	TCT	2	6	2670	2675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685392
48	NC_019775	TTA	2	6	2694	2699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440685392
49	NC_019775	CGT	2	6	2704	2709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440685392
50	NC_019775	TCTT	2	8	2817	2824	0 %	75 %	0 %	25 %	440685392
51	NC_019775	TTA	2	6	2874	2879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440685392
52	NC_019775	AT	3	6	2901	2906	50 %	50 %	0 %	0 %	440685392
53	NC_019775	AAT	2	6	3001	3006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440685392
54	NC_019775	ACT	2	6	3048	3053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685392
55	NC_019775	TAA	2	6	3161	3166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440685392
56	NC_019775	T	6	6	3167	3172	0 %	100 %	0 %	0 %	440685392
57	NC_019775	T	6	6	3241	3246	0 %	100 %	0 %	0 %	440685392
58	NC_019775	T	7	7	3260	3266	0 %	100 %	0 %	0 %	440685392
59	NC_019775	CTTATC	2	12	3323	3334	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	440685392
60	NC_019775	GTT	2	6	3347	3352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440685392
61	NC_019775	CGT	2	6	3409	3414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440685392
62	NC_019775	ATCAGC	2	12	3422	3433	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	440685392
63	NC_019775	ACC	2	6	3446	3451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440685392
64	NC_019775	TGA	2	6	3456	3461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440685392
65	NC_019775	AGT	2	6	3471	3476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440685392
66	NC_019775	T	6	6	3476	3481	0 %	100 %	0 %	0 %	440685392
67	NC_019775	CT	3	6	3502	3507	0 %	50 %	0 %	50 %	440685392
68	NC_019775	T	6	6	3507	3512	0 %	100 %	0 %	0 %	440685392
69	NC_019775	TCT	2	6	3588	3593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685392
70	NC_019775	TC	3	6	3656	3661	0 %	50 %	0 %	50 %	440685392
71	NC_019775	CTTTC	2	10	3733	3742	0 %	60 %	0 %	40 %	440685392
72	NC_019775	AGA	2	6	3833	3838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440685392
73	NC_019775	TCT	2	6	3873	3878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685392
74	NC_019775	TCTA	2	8	3893	3900	25 %	50 %	0 %	25 %	440685392
75	NC_019775	GGA	2	6	3912	3917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440685392
76	NC_019775	AT	3	6	3974	3979	50 %	50 %	0 %	0 %	440685392
77	NC_019775	TCA	2	6	3981	3986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685392
78	NC_019775	ATC	2	6	4016	4021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685392
79	NC_019775	TTACG	2	10	4114	4123	20 %	40 %	20 %	20 %	440685392
80	NC_019775	TAT	2	6	4138	4143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440685392
81	NC_019775	CTTT	2	8	4166	4173	0 %	75 %	0 %	25 %	440685392
82	NC_019775	AAG	2	6	4182	4187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440685392
83	NC_019775	CTA	2	6	4390	4395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685392
84	NC_019775	GCT	2	6	4434	4439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440685392
85	NC_019775	A	6	6	4473	4478	100 %	0 %	0 %	0 %	440685392
86	NC_019775	TGG	2	6	4496	4501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440685392
87	NC_019775	CTA	2	6	4585	4590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685392
88	NC_019775	ACC	2	6	4606	4611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440685392
89	NC_019775	AATA	2	8	4698	4705	75 %	25 %	0 %	0 %	440685392
90	NC_019775	TGC	2	6	4745	4750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440685392
91	NC_019775	TTC	2	6	4784	4789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685392
92	NC_019775	AAT	2	6	4875	4880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440685392
93	NC_019775	CT	3	6	4897	4902	0 %	50 %	0 %	50 %	440685392
94	NC_019775	AAT	2	6	4998	5003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440685392
95	NC_019775	AGC	3	9	5917	5925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685393
96	NC_019775	ATC	2	6	5992	5997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685393
97	NC_019775	TAGT	2	8	6072	6079	25 %	50 %	25 %	0 %	440685393
98	NC_019775	TAG	2	6	6174	6179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440685393
99	NC_019775	AGT	2	6	6188	6193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440685393
100	NC_019775	TTGG	3	12	6219	6230	0 %	50 %	50 %	0 %	440685393
101	NC_019775	ATCT	2	8	6311	6318	25 %	50 %	0 %	25 %	440685394
102	NC_019775	ATC	2	6	6360	6365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685394
103	NC_019775	TGT	2	6	6420	6425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440685394
104	NC_019775	ACG	2	6	6805	6810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685395
105	NC_019775	TGA	2	6	6826	6831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440685395
106	NC_019775	AGTA	2	8	6883	6890	50 %	25 %	25 %	0 %	440685395
107	NC_019775	A	6	6	6959	6964	100 %	0 %	0 %	0 %	440685395
108	NC_019775	CAC	2	6	6990	6995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440685395
109	NC_019775	AGC	2	6	7147	7152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685395
110	NC_019775	ACAACC	2	12	7178	7189	50 %	0 %	0 %	50 %	440685396
111	NC_019775	GAT	2	6	7325	7330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440685396
112	NC_019775	CTG	2	6	7446	7451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440685396
113	NC_019775	CAGC	2	8	7475	7482	25 %	0 %	25 %	50 %	440685396
114	NC_019775	TGG	2	6	7540	7545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440685396
115	NC_019775	AACC	2	8	7568	7575	50 %	0 %	0 %	50 %	440685396
116	NC_019775	ATT	2	6	7613	7618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440685396
117	NC_019775	GAA	2	6	7628	7633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440685396
118	NC_019775	AG	3	6	7727	7732	50 %	0 %	50 %	0 %	440685396
119	NC_019775	CAACG	2	10	7733	7742	40 %	0 %	20 %	40 %	440685396
120	NC_019775	AAC	2	6	7788	7793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440685396
121	NC_019775	GAT	2	6	7832	7837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440685396
122	NC_019775	AGC	2	6	7869	7874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685396
123	NC_019775	CAG	2	6	7882	7887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685396
124	NC_019775	GCT	2	6	8254	8259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440685397
125	NC_019775	TTG	2	6	8290	8295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440685397
126	NC_019775	GA	3	6	8420	8425	50 %	0 %	50 %	0 %	440685397
127	NC_019775	TTA	2	6	8428	8433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440685397
128	NC_019775	AAC	2	6	8446	8451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440685397
129	NC_019775	A	6	6	8455	8460	100 %	0 %	0 %	0 %	440685397
130	NC_019775	AG	3	6	8467	8472	50 %	0 %	50 %	0 %	440685397
131	NC_019775	GA	3	6	8478	8483	50 %	0 %	50 %	0 %	440685397
132	NC_019775	TAC	2	6	8492	8497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685397
133	NC_019775	CAAC	2	8	8498	8505	50 %	0 %	0 %	50 %	440685397
134	NC_019775	A	7	7	8534	8540	100 %	0 %	0 %	0 %	440685397
135	NC_019775	GCT	2	6	8666	8671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440685398
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.